1 - Le nom de la société où travaille Andersson est Metacortex. Un peu plus tard, dans les couloirs, ce nom devient Meta Cortechs.
2 - Morphéus dit à Néo qu'il ignore qui a commencé cette guerre, alors que dans l'Animatix "La seconde renaissance" qui est symbolisé par la mémoire de Zion, la réponse est donnée.
3 - Chez l'oracle quand l'enfant face à Neo prend la cuillère, le côté creux est vers Neo, et juste après l'avoir tordue, c'est le côté bombé qui est vers lui.
4 - Trinity et Neo tombent sur un mur. Le mur est bien cassé. Sur le plan suivant , le mur est à peine cassé. (80e minute)
5 - Les militaires tirent sur les piliers. On les voit troués de balles. Sur le plan suivant, il n'y a plus de traces de balles. (98e minute)
6 - Lors du "bullet time" (ralenti) dans le métro, les culasses des 2 armes ne bougent pas quand neo et smith se tirent dessus.